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인플루엔자 유전체 (Influenza genome) 인플루엔자 바이러스는 13.5 k nucleotide를 갖고 있는데, 일반적인 RNA dependent RNA polyemrase 효소의 error-prone replication 정확도가 1 out of 10,000 이라고 볼때 인플루엔자 바이러스가 한번 복제할 때마다 하나의 mutation이 일어나게 된다.바이러스는 8개의 RNA fragment를 갖고 있어서 여러가지 숙주에서 유래하는 변이주들 사이에 재결합 (recombination)이 가능하기 때문에 새로운 변이주 발생 확률이 높다. 2009년 H1N1 pandemic 바이러스는 조류, 돼지, 인체에서 유래하는 RNA segment의 3중 재결합 바이러스로 잘 알려져 있다.최근 GenBank에서 보유하고 있는 인플루엔자 유전체 genome이 10.. 2013. 1. 17.
노로바이러스 식중독 II (norovirus food poisoning II) 지난주 일본과 영국에서 노로바이러스 식중독 발생이 증가하면서 세계적으로 감염이 확대되고 있다는 뉴스매체의 보도를 접하고 있다. 특히 2012년은 전년도에 비하여 노로바이러스 발생이 2배 이상 증가하는 데 이는 집단급식의 증가와 맞물려있다. 국내에만 전국적으로 4만개소 이상의 집단급식 시설이 있다는 점을 감안하면, 병원, 학교, 보육시설 집단급식소에서 겨울철 노로바이러스 변종이 발생하여 감염이 확산되는 것이 앞으로 더욱 빈번하게 될 가능성이 높다. RNA 바이러스로서 새로운 변이주가 쉽게 발생한다는 점, 다양한 바이러스 유전형으로 인체 면역저항성이 쉽게 나타나지 않는 점이 문제다. 바이러스성 식중독을 일으키는 바이러스로는 노로바이러스 외에 로타바이러스가 있지만, 로타바이러스는 백신이 이미 개발되어 있는 반.. 2013. 1. 16.
인플루엔자 계절 (Influenza season) 21013년 1월부터 미국에서 인플루엔자 발생이 현저히 증가하고 사망자가 수백명에 이른다는 보도가 있다. 지난 12월말 블로그에서도 밝힌 바 있지만, 임산부, 65세 이상 노인층, 당뇨 및 호흡기 환자들의 주의를 요한다. 그러나 아직까지 국내에서 인플루엔자 유사환자가 급격히 증가한다는 질병관리본부 (KCDC) 보고는 없으며, 일반적인 국내 인플루엔자 겨울시즌에 발생하는 빈도가 보이고 있다. 이는 미국에서 발생하고 있는 H3N2 아형과 국내에서의 H1N1 아형 바이러스의 차이에 기인하는 것으로 보이며, 지난 10년간 통계를 보면 미국과 한국에서 인플루엔자 최대 발생시점이 반드시 일치하는 것은 아니다. 실제 생물구조정보연구실 social network data 분석을 이용한 인플루엔자 trend 역시 201.. 2013. 1. 16.
학교 운동장 (3) (Playground for kids) 물론 비만을 박테리아 영향만으로 설명할 수는 없지만, 미국 아이들의 30%가 제왕절개 C-section으로 태어나고, 중국은 도시지역 2/3 이상 신생아가 C-section으로 태어나며, 점점 소가족으로 변화하는 추세에, 깨끗한 물과 주위환경으로 미생물 노출이 감소하는 추세는 인체가 필요로 하는 미생물을 잃어버리는 미생물 unbalance의 심각한 우려를 낳고 있다. 2000년대에 들어와서 우리나라 모든 학교 운동장이 인조 잔디화되면서 어린 학생들이 자연스럽게 노출되었던 흙으로부터 멀어지는 일은 유익한 미생물로 부터 어린 아이들을 격리시킴으로써 건강한 삶을 위한 미생물 balance를 아이러니컬하게도 막는 일이 되고 있다. 최근 Caltech 대학의 Mazmanian 연구팀은 Bacteroides fra.. 2013. 1. 16.

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